- 家
- Biocumon 3.12.
- 软件包
- sc
sc
 |
 |
 |
 |
 |
 |
 |
DOI：10.18129 / b9.bioc.scuttle
单细胞RNA-SEQ分析实用程序
Biocometiond版本：释放（3.12）
提供用于执行单细胞分析的基本实用程序功能，专注于简单的归一化，质量控制和数据转换。还提供一些辅助功能，以帮助开发其他包。
作者：Aaron LUN [AUT，CRE]，Davis McCarthy [Aut]
维护者：Aaron LUN
引文（从R内，输入引文（“SCUTTE”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！percennamespace（“biocmanager”，静静= true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“scuttle”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“SCUTTE”）
| HTML. | r script. | 包概述 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.0.4 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 3.12（R-4.0）（<6个月） |
| 执照 | GPL-3. |
| 依靠 | SinglecellexPeriment. |
| 进口 | 方法，Utils，统计数据，矩阵那rcpp.那生物根系那S4Vectors.那生物相投那Genomicranges.那概括分析那delayedarray那delayedmatrixstats那海滩日 |
| 链接到 | rcpp.那海滩日 |
| 建议 | 生物焦那kn那scrnapeq.那RAMAMAMDOW.那testthat. |
| 系统要求 | C ++ 11. |
| 加强 | |
| URL. | |
| 取决于我 | |
| 进口我 | batchelor.那Dropletuls.那撒尿那scdblfinder.那斯那Velociraptor. |
| 建议我 | 吹风丝那hcadata.那单歌者那狙击手那泼溅那TSCan. |
| 链接给我 | Dropletuls.那斯 |
| 建立报告 |
包档案包
跟随安装在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | scuttle_1.0.4.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | scuttle_1.0.4.zip. |
| Macos 10.13（高塞拉） | scuttle_1.0.4.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/scuttle |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondudard.org：包装/ scuttle |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/scuttle/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
| BIOC 3.12的旧源包 | 源档案 |
