SEQBIAS.

DOI：10.18129 / b9.bioc.seqbias.

高吞吐量测序数据中按位置偏置的估计

Bioconductor版本：释放（3.13）

该包利用简单的贝叶斯网络实现高吞吐量测序数据的每个位置测序偏差模型，其结构和参数在一组对准的读取和参考基因组序列上训练。

作者：Daniel Jones

维护者：Daniel Jones

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！qualocamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“seqbias”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

BROWSEVIGNETTES（“SEQBIAS”）

PDF.	r script.	评估和调整高吞吐量测序数据中的技术偏差
PDF.		参考手册

细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.40.0
在生物导体中以来	BIOC 2.8（R-2.13）（10年）
执照	LGPL-3
依靠	r（> = 3.0.2），Genomicranges.（> = 0.1.0），生物仪器（> = 2.15.0），方法
进口
链接到	rhtslib.（> = 1.15.3）
建议	RSAMTOOLS.那ggplot2.
系统要求	GNU制作
加强
URL.
取决于我	reqon.
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	seqbias_1.40.0.tar.gz.
Windows二进制文件
Macos 10.13（高塞拉）	seqbias_1.40.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/seqbias.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocadiond.org：包/ seqbias
包短网址	https://biocumon.org/packages/seqbias/
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