Bioconductor版本:释放(3.13)
SEQSETVIS使下一个GEN测序数据中的基因组位点的可视化和分析能够进行可视化和分析。虽然SEQSETVIS被设计用于比较Mulitple Chip-SEQ样本,但是该包是域名禁止的,并且允许处理多种基因组坐标文件(床上文件)和信号文件(BigWig文件堆积来自BAM文件)。
作者:Joseph R Boyd [Aut,CRE]
维护者:Joseph R Boyd
引文(从R内,输入引文(“SEQSETVIS”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“seqsetvis”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“SEQSETVIS”)
HTML. | r script. | 概述和用例 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.12.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 3.7(R-3.5)(3年) |
执照 | mit +文件执照 |
依靠 | r(> = 3.6),ggplot2. |
进口 | data.table.那Eulerr.那Genomeinfodb.那基因管理那Genomicranges.那ggplotify.,grdevices,网格,绞喉那林马, 方法,pbapply.那pbmcapply.那PNG.那rcolorbrewer.那RSAMTOOLS.那rtracklayer.那S4Vectors.,统计,沮丧 |
链接到 | |
建议 | biocfilecache.那Biocmanager.那生物焦那Chippeakanno.那Covr.那电台那kn那RAMAMAMDOW.那testthat. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | seqsetvis_1.12.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | seqsetvis_1.12.0.zip. |
Macos 10.13(高塞拉) | seqsetvis_1.12.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/seqsetvis. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ seqsetvis |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/seqsetvis/ |
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