seqsetvis.

DOI:10.18129 / b9.bioc.seqsetvis.

基于基于可视化的下一页排序数据

Bioconductor版本:释放(3.13)

SEQSETVIS使下一个GEN测序数据中的基因组位点的可视化和分析能够进行可视化和分析。虽然SEQSETVIS被设计用于比较Mulitple Chip-SEQ样本,但是该包是域名禁止的,并且允许处理多种基因组坐标文件(床上文件)和信号文件(BigWig文件堆积来自BAM文件)。

作者:Joseph R Boyd [Aut,CRE]

维护者:Joseph R Boyd

引文(从R内,输入引文(“SEQSETVIS”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“seqsetvis”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“SEQSETVIS”)

HTML. r script. 概述和用例
PDF. 参考手册
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文本 执照

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.12.0
在生物导体中以来 BIOC 3.7(R-3.5)(3年)
执照 mit +文件执照
依靠 r(> = 3.6),ggplot2.
进口 data.table.Eulerr.Genomeinfodb.基因管理Genomicranges.ggplotify.,grdevices,网格,绞喉林马, 方法,pbapply.pbmcapply.PNG.rcolorbrewer.RSAMTOOLS.rtracklayer.S4Vectors.,统计,沮丧
链接到
建议 biocfilecache.Biocmanager.生物焦Chippeakanno.Covr.电台knRAMAMAMDOW.testthat.
系统要求
加强
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包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 seqsetvis_1.12.0.tar.gz.
Windows二进制文件 seqsetvis_1.12.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) seqsetvis_1.12.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/seqsetvis.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ seqsetvis
包短网址 https://biocumon.org/packages/seqsetvis/
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