签名探索

DOI：10.18129 / b9.bioc.signaturesearch.

基因表达的环境和功能性富集分析相结合

Bioconductor版本：释放（3.13）

该包实现用于执行基因表达签名（GES）搜索的算法和数据结构，并随后用专用的富集方法解释功能上的结果。

作者：Yuzhu Duan [Cre，Aut]，Thomas Girke [Aut]

维护者：裕珠段

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.1”）并输入：

if（！percenameSpace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“signaturesearch”）

对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。

文件

要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：

Browsevignettes（“Signaturesearch”）

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	1.6.0
在生物导体中以来	BIOC 3.10（R-3.6）（1.5年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.6.0），rcpp.那概括分析
进口	annotationdbi.那ggplot2.那data.table.那实验室那HDF5Array.那Magrittr.那rsqlite.那dplyr.那FGSEA.那秤， 方法，qvalue.，统计数据，utils，重塑2.那visnetwork.那生物相投那FastMatch.那反弹.DB.那矩阵那ClusterProfiler.那读书那剂量那RHDF5.那GSEABASE.那delayedarray
链接到	rcpp.
建议	kn那testthat.那RAMAMAMDOW.那生物焦那org.hs.eg.db.
系统要求	C ++ 11.
加强
URL.	https://github.com/yduan004/signaturesearch/
Bugreports.	https://github.com/yduan004/signaturesearch/sissues.
取决于我
进口我	signaturesearchdata.
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包	signaturesearch_1.6.0.tar.gz.
Windows二进制文件	signaturesearch_1.6.0.zip.（32-＆64位）
Macos 10.13（高塞拉）	signaturesearch_1.5.6.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/signaturesearch.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/签名
包短网址	https://biocumon.org/packages/signaturesearch/
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