sigsquared

DOI:10.18129 / B9.bioc.sigsquared

功能验证信号通路的基因签名生成

Bioconductor版本:发行版(3.15)

通过利用由二元阈值定义的患者队列的统计特性(生存对数秩检验),通过对成本函数的优化,通过sigsquared包识别预后不良的患者,减少I型和II型错误。

作者:UnJin李

维护人:UnJin Lee < UnJin at uchicago.edu>

引用(从R中,输入引用(“sigsquared”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!install.packages("BiocManager") BiocManager::install("sigsquared")

对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档,请从R开始并输入:

browseVignettes(“sigsquared”)

PDF R脚本 SigSquared
PDF 参考手册

细节

biocViews 2021年欧洲杯
版本 1.28.0
Bioconductor自 BioC 3.1 (R-3.2)(7.5年)
许可证 3版GPL的
取决于 R(>= 3.2.0),方法
进口 Biobase生存
链接
建议 RUnitBiocGenerics
SystemRequirements
增强了
URL
取决于我
进口我
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包 sigsquared_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 sigsquared_1.28.0.zip(64位)
macOS二进制(x86_64) sigsquared_1.28.0.tgz
源库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sigsquared
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/ sigsquared
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/sigsquared/
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