生物导体版本:版本(3.12)
一种简单的单样本基因签名评分方法,该方法使用基于等级的统计量来分析样本的基因表达谱。它在单样本水平上得分基因集的表达活性。
作者:Ruqian Lyu [AUT,CTB],Momeneh Foroutan [AUT,CTB],Dharmesh D. Bhuva [AUT,CRE]
维护者:Dharmesh D. Bhuva
引用(从r内,输入引用(“ singscore”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ singscore”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“ singscore”)
html | R脚本 | 单个样本评分 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.10.0 |
在生物导体中 | Bioc 3.7(R-3.5)(3年) |
执照 | GPL-3 |
要看 | R(> = 3.6) |
进口 | 方法,统计,图形,GGPLOT2,grdevices,Ggrepel,,,,gseabase,,,,情节,,,,花花公子,,,,plyr,,,,马格里特,,,,重塑,,,,EDGER,,,,rcolorbrewer,,,,生物酶,,,,生物比较,,,,总结性特征,,,,矩阵,,,,RESHAPE2,,,,S4VECTORS |
链接 | |
建议 | 尼特,,,,rmarkDown,,,,测试 |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://davislaboratory.github.io/singscore |
BugReports | https://github.com/davislaboratory/singscore/issues |
取决于我 | |
进口我 | singscoreamlmutations,,,,tbsignatureprofiler |
建议我 | |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | singscore_1.10.0.tar.gz |
Windows二进制 | singscore_1.10.0.zip(32-和64位) |
MacOS 10.13(高山脉) | singscore_1.10.0.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/singscore |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/singscore |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/singscore/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
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