skewr

doi：10.18129/b9.bioc.skewr

可视化Illumina的人类甲基化450k Beadchip产生的强度

生物导体版本：版本（3.13）

SKEWR包是可视化Illumina人类甲基化450k Beadchip的输出的工具，以帮助质量控制。它创建了一个由九个地块组成的面板。其中六个图代表了甲基化强度的密度或由485,577个总探针中的三个子集之一给出的未甲基化强度。这些子集包括I型红色，I型绿色和II型。其余三个分布给出了这三个子集的β值的密度。这九个图中的每个图都可以选择显示“ RS” SNP探针的分布以及与印迹基因相关的探针，作为位于X轴上方上方的一系列“ tick”标记。

作者：Ryan Putney [Cre，Aut]，Steven Eschrich [AUT]，Anders Berglund [AUT]

维护者：ryan putney

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ skewr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ skewr”）

PDF	R脚本	SKEWR软件包的简介
PDF		参考手册

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.24.0
在生物导体中	Bioc 3.1（R-3.2）（6年）
执照	GPL-2
要看	r（> = 3.1.1），甲基菌，，，，西瓜，，，，Mixsmsn，，，，Illuminahumanmethylation450Kmanifest
进口	Minfi，，，，S4VECTORS（> = 0.19.1），rcolorbrewer
链接
建议	地球，，，，尼特，，，，Minfidata
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	skewr_1.24.0.tar.gz
Windows二进制	skewr_1.24.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	skewr_1.24.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/skewr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/skewr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/skewr/
软件包下载报告	下载统计