空间Heatmap

doi:10.18129/b9.bioc.spatialheatmap

空间Heatmap

生物导体版本:版本(3.12)

FasialHeatMap软件包提供了可视化生物学测定的细胞,组织和器官特异性数据的功能,该数据通过根据数字颜色键在解剖图像中定义的相应空间特征着色。

作者:Jianhai Zhang [AUT,TRL,CRE],Jordan Hayes [aut],Le Zhang [aut],Bing Yang [aut],Wolf Frommer [aut],Julia Bailey-Serres [aut],Thomas Girke [aut]

维护者:jianhai Zhang

引用(从r内,输入引用(“空间HeatMap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ spatialHeatMap”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:

browsevignettes(“空间HeatMap”)

html R脚本 空间HeatMap:在解剖图像和网络图中可视化空间测定
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细节

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版本 1.0.0
在生物导体中 Bioc 3.12(R-4.0)(<6个月)
执照 艺术2.0
要看
进口 av,,,,deseq2,,,,EDGER,,,,WGCNA,,,,flashclust,,,,htmlwidgets,,,,GeneFilter,,,,GGPLOT2,,,,ggdendro,,,,格里姆波特, 网格,栅格,,,,GPLOTS,,,,Igraph,,,,RSVG,,,,闪亮的,,,,DynamiCtreCut,grdevices,图形,ggplotify,,,,情节,,,,洛尔,统计总结性特征,,,,发光的dashboard,utils,Visnetwork, 方法,XML2,,,,Yaml
链接
建议 尼特,,,,rmarkDown,,,,生物使用,,,,运行,,,,生物基因,,,,Data.Table,,,,表达,,,,DT,,,,RESHAPE2,,,,生物酶,,,,地球,,,,闪亮的widgets
系统要求
增强
URL https://github.com/jianhaizhang/spatialheatmap
BugReports https://github.com/jianhaizhang/spatialheatmap/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 spatialHeatMap_1.0.0.0.tar.gz
Windows二进制 spatialHeatMap_1.0.0.0.zip
MacOS 10.13(高山脉) spatialHeatMap_1.0.0.0.tgz
源存储库 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spatialheatmap
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.bioconductor.org:packages/spatialHeatMap
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/spatialheatmap/
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