spicyR

DOI:10.18129 / B9.bioc.spicyR

原位细胞术数据的空间分析

生物导体版本:发布(3.13)

spicyR提供了一系列功能，以帮助分析免疫荧光和大量细胞术成像数据，以及其他分析，可以深入显型单个细胞及其空间位置。

作者:Nicolas Canete [aut]， Ellis Patrick [aut, cre]

维护者:埃利斯帕特里克<埃利斯。帕特里克在sydney.edu.au >

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!安装BiocManager::install("spicyR")

有关较旧版本的R，请参阅适当的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的软件包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“spicyR”)

超文本标记语言	R脚本	介绍SegmentedCells
超文本标记语言	R脚本	介绍了辣
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
Bioconductor自	BioC 3.11 (R-4.0)(1年)
许可证	GPL (> = 2)
取决于	R (> = 4.0.0)
进口	ggplot2，concaveman，BiocParallel，spatstat.core，spatstat.geom，lmerTest，BiocGenerics，S4Vectors，lme4、方法、mgcv，pheatmap，rlanggrDevices,IRanges统计数据,data.table，dplyr，tidyr
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/ellispatrick/spicyR/issues
取决于我
进口我	lisaClust
建议我
我的链接
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	spicyR_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	spicyR_1.4.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	spicyR_1.4.0.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/spicyR
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:包/ spicyR
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/spicyR/
包下载报告	下载数据