生物导体版本:版本(3.12)
Splatter是用于模拟单细胞RNA测序计数数据的软件包。它提供了一个简单的接口,用于创建可重现且有据可查的复杂模拟。可以从真实数据估算参数,并提供功能以比较真实和模拟数据集。
作者:卢克·扎皮亚(Luke Zappia)[AUT,CRE],Belinda Phipson [AUT]
,克里斯蒂娜·阿佐迪[CTB]
,Alicia Oshlack [aut]
维护者:Luke Zappia
引用(从r内,输入引用(“飞溅”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.0”)并输入:
if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ splatter”)
对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放。
要查看系统中安装此软件包的版本的文档,请启动R并输入:
browsevignettes(“飞溅”)
html | R脚本 | 溅起包装的介绍 |
html | R脚本 | SPLAT仿真参数 |
html | R脚本 | SPLATPOP模拟 |
参考手册 | ||
文本 | 消息 | |
文本 | 执照 |
生物浏览 | 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.14.1 |
在生物导体中 | Bioc 3.5(R-3.4)(4年) |
执照 | GPL-3 +文件执照 |
要看 | r(> = 4.0),Singlecellexperiment |
进口 | 生物基因,,,,生物比较,,,,检查员(> = 2.0.0),EDGER,,,,fitdistrplus,,,,GGPLOT2,,,,Locfit,,,,矩阵, 方法,秤,,,,评分(> = 1.15.16),统计,总结性特征,utils,蜡笔,,,,S4VECTORS,grdevices |
链接 | |
建议 | 生物使用,,,,COVR,,,,牛仔图,,,,魔术,,,,尼特,,,,limsolve,,,,LME4,,,,进步,,,,PSCL,,,,测试,,,,预处理,,,,rmarkDown,,,,SCDD,,,,斯克兰,,,,MFA,,,,苯酚,,,,基本(> = 1.7.10),Zinbwave,,,,sparsedc,,,,生物管理器,,,,拼写,,,,Igraph,,,,砍伐,,,,生物兴奋,,,,变体,,,,生物弦,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,iranges |
系统要求 | |
增强 | |
URL | https://github.com/oshlack/splatter |
BugReports | https://github.com/oshlack/splatter/issues |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | 新浪潮,,,,SCPCA,,,,总结 |
链接到我 | |
构建报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。
源包 | Splatter_1.14.1.tar.gz |
Windows二进制 | Splatter_1.14.1.zip |
MacOS 10.13(高山脉) | Splatter_1.14.1.tgz |
源存储库 | git克隆https://git.bioconductor.org/packages/splatter |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.bioconductor.org:包装/飞溅 |
包装短URL | //www.andersvercelli.com/packages/splatter/ |
软件包下载报告 | 下载统计 |
Bioc 3.12的旧源软件包 | 来源存档 |
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