Srnadiff

doi：10.18129/b9.bioc.srnadiff

从RNA-seq数据中找到差异表达的未注释的基因组区域

生物导体版本：版本（3.13）

SRNADIFF是一个软件包，在不依赖现有注释的情况下，在基础分辨率级别发现与RNA-Seq数据的区域不同。为此，包装实现了识别的 - 然后是注向方法，该方法基于结合两种管道方法的想法。它将BAM文件读为输入，并将列表与调整后的P值一起输出列表。

作者：Zytnicki Matthias [AUT，CRE]，Gonzalez Ignacio [AUT]

维护者：zytnicki matthias

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ srnadiff”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Srnadiff”）

html	R脚本	Srnadiff包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.12.2
在生物导体中	Bioc 3.7（R-3.5）（3年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.6）
进口	RCPP（> = 0.12.8），方法，DevTools，，，，S4VECTORS，，，，GenomeInfodB，，，，rtracklayer，，，，总结性特征，，，，iranges，，，，基因组机，，，，deseq2，，，，EDGER，，，，贝塞克，，，，rsamtools，，，，GenomicFeatures，，，，基因组签名，grdevices，GVIZ，，，，生物比较，，，，生物使用，，，，生物管理器
链接	RCPP
建议	尼特，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物管理器，，，，生物使用
系统要求	C ++ 11
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	srnadiff_1.12.2.2.tar.gz
Windows二进制	srnadiff_1.11.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	srnadiff_1.12.2.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/srnadiff
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/srnadiff
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/srnadiff/
软件包下载报告	下载统计
Bioc 3.13的旧源软件包	来源存档