超级人

doi：10.18129/b9.bioc.supersigs

有监督的突变签名

生物导体版本：版本（3.15）

从癌症基因组中的单核苷酸变体中产生超级药物（监督突变特征）。软件包中包含的功能使用户可以从其数据中学习监督的突变签名，并将其应用于新数据。该方法基于Afsari（2021，Elife）中描述的方法。

作者：Albert Kuo [AUT，CRE]，Yifan Zhang [aut]，Bahman Afsari [aut]，Cristian Tomasetti [aut]

维护者：Albert Kuo

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ Supersigs”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Supersigs”）

html	R脚本	使用超级人
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.4.0
在生物导体中	Bioc 3.13（R-4.1）（1。5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1）
进口	断言，，，，商在，，，，dplyr，，，，花花公子，，，，rsample， 方法，rlang，utils，生物弦，统计总结性特征
链接
建议	bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19，，，，bsgenome.hsapiens.ucsc.hg38，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，GGPLOT2，，，，测试，，，，变体
系统要求
增强
URL	https://tomasettilab.github.io/supersigs/
BugReports	https://github.com/tomasettilab/supersigs/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	supersigs_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	supersigs_1.4.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	supersigs_1.4.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/supersigs
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/超级
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/supersigs/
软件包下载报告	下载统计