Tidybulk.

DOI:10.18129 / b9.bioc.tidybulk.

将转录组织带到俗气

Biocometiond版本:释放(3.12)

这是允许模块化,管道友好和整洁的时尚对RNA测序数据进行探索和计算的实用功能的集合。

作者:Stefano Mangiola [Aut,Cre],Maria Doyle [CTB]

维护者:Gmail.com的Stefano Mangiola

引文(从R内,输入引文(“Tidybulk”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.0”)并输入:

if(!perceneNameSpace(“biocmanager”,静静= true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“tidybulk”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“TIDYBULK”)

HTML. r script. 与基础r比较
HTML. r script. 稿件代码 - 差分转录性丰富
HTML. r script. 稿件代码 - 转录签名识别
HTML. r script. Tidybulk包的概述
PDF. 参考手册

细节

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版本 1.2.0
在生物导体中以来 BIOC 3.11(R-4.0)(1年)
执照 GPL-3
依靠 r(> = 4.0.0)
进口 娇媚读书dplyr.Magrittr.Tidyr.stringr.rlang.邮风预处理核,统计数据,平行,实用程序,生命周期概括分析, 方法
链接到
建议 生物焦testthat.vctrs.annotationdbi.Biocmanager.rsubread.E1071.edger.林马org.hs.eg.db.org.mm.eg.db.SVA.施说knQPDF.Covr.Seurat.kernsmooth.RTSNE.S4Vectors.ggplot2.WIDYR.ClusterProfiler.msigdbr.deseq2.扫帚生存靴子Betareg.tidyheatmap.帕西拉GGRepel.devtools.功能
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源包 tidybulk_1.2.0.tar.gz.
Windows二进制文件 tidybulk_1.2.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) tidybulk_1.2.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/tidybulk.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondudard.org:包装/ Tidybulk
包短网址 https://biocumon.org/packages/tidybulk/
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