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- Biocumon 3.12.
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- 蒂格雷
蒂格雷
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DOI：10.18129 / b9.bioc.tigre.
通过高斯过程重建表达转录因子推断
Biocometiond版本：释放（3.12）
Tigre封装实现了我们从单个输入主题网络分析了基因表达时间序列的高斯工艺差分方程模型的方法。该包装可用于推断出从已知靶基因的表达测量的不观察到的转录因子（TF）蛋白质浓度，或用于排名TF的候选靶标。
作者：安蒂·赫克拉，裴高，乔纳丹罗比恩，米卡·佩特提Matikainen，Magnus Rattray，Neil D. Lawrence
维护者：赫尔辛基的Antti Honkela
引文（从R内，输入引文（“Tigre”））：
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.0”）并输入：
if（！quancamespace（“biocmanager”，squilly = true））install.packages（“biocmanager”）biocmanager ::安装（“tigre”）
对于旧版本，请参阅相应的生物导体释放。
文件
要查看系统中安装此包版本的文档，请启动r并输入：
BROWSEVIGNETTES（“TIGRE”）
| PDF. | r script. | Tigre用户指南 |
| PDF. | 参考手册 | |
| 文本 | 消息 |
细节
| Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
| 版本 | 1.44.0 |
| 在生物导体中以来 | BIOC 2.6（R-2.11）（11年） |
| 执照 | AGPL-3 |
| 依靠 | r（> = 2.11.0），生物根系那BioBase. |
| 进口 | 方法，annotationdbi.那贡献，图形，grdevices，stats，utils，注释那DBI.那rsqlite. |
| 链接到 | |
| 建议 | drosgenome1.db.那彪马那lumi.那生物焦那Biocmanager. |
| 系统要求 | |
| 加强 | |
| URL. | https://github.com/ahonkela/tigre. |
| Bugreports. | https://github.com/ahonkela/tigre/issues. |
| 取决于我 | |
| 进口我 | |
| 建议我 | |
| 链接给我 | |
| 建立报告 |
包档案包
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
| 源包 | tigre_1.44.0.tar.gz. |
| Windows二进制文件 | tigre_1.44.0.zip.（32-＆64位） |
| Macos 10.13（高塞拉） | tigre_1.44.0.tgz. |
| 源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/tigre. |
| 源存储库（开发人员访问） | git clone git@git.biocondudard.org：包/蒂格雷 |
| 包短网址 | https://biocumon.org/packages/tigre/ |
| 包裹下载报告 | 下载统计信息 |
