timeOmics

DOI:10.18129 / B9.bioc.timeOmics

时间课程多组学数据集成

Bioconductor版本:Release (3.15)

timeOmics是一个通用的数据驱动框架，用于整合在同一生物样本上测量的多组纵向数据，并选择同一样本组内具有强关联的关键时间特征。时间组学的主要步骤是:1。平台和特定时间的归一化和过滤步骤;2.将每种生物建模为一个时间表达剖面;3.具有相同表达谱随时间变化的聚类特征;4.事后验证步骤。

作者:Antoine Bodein [aut, cre]， Olivier Chapleur [aut]， Kim-Anh Le Cao [aut]， Arnaud Droit [aut]

维护者:Antoine Bodein < Antoine . Bodein。1在ulval .ca>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“timeOmics”)

超文本标记语言	R脚本	timeOmics
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文本		新闻

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.7.1上
在Bioconductor	BioC 3.11 (R-4.0)(2年)
许可证	GPL-3
取决于	mixOmics， r (>= 4.0)
进口	dplyr，tidyr，宠物猫，purrr，magrittr，ggplot2，stringr，ggrepel，propr，航空航天，plyr
链接
建议	BiocStyle，knitr，rmarkdown，testthat，雪，tidyverse，igraph，gplots
SystemRequirements
增强了
URL
BugReports	https://github.com/abodein/timeOmics/issues
全靠我
进口我
建议我	netOmics
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	timeOmics_1.7.1.tar.gz
Windows二进制	timeOmics_1.7.1.zip(64位)
macOS 10.13 (High Sierra)	timeOmics_1.7.2.tgz
源库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/timeOmics
源存储库(开发人员访问)	git克隆git@git.bioconductor.org:packages/timeOmics
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/timeOmics/
软件包下载报告	下载数据