TopDownr

doi：10.18129/b9.bioc.topdownr

自上而下蛋白质组学中的破碎条件的研究

生物导体版本：版本（3.13）

TopDownr软件包允许自动研究碎片条件。它创建热轨道融合灯液方法文件来测试数百个碎片条件。此外，它提供了分析和处理生成的MS数据的功能，并确定最大化整体碎片覆盖的最佳条件。

作者：Sebastian Gibb [AUT，CRE]，Pavel Shliaha [aut]，OleNørregaardJensen [aut]

维护者：塞巴斯蒂安·吉布（Sebastian Gibb）

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ topdownr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ topdownr”）

html	R脚本	topDownr的数据生成
html	R脚本	topdownr的分裂分析
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.14.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（3.5岁）
执照	GPL（> = 3）
要看	R（> = 3.5），方法，生物基因（> = 0.20.0），蛋白质（> = 1.10.0），生物弦（> = 2.42.1），S4VECTORS（> = 0.12.2）
进口	grdevices，统计，工具，utils，生物酶，，，，矩阵（> = 1.2.10），MSNBase（> = 2.3.10），GGPLOT2（> = 2.2.1），MZR（> = 2.11.4）
链接
建议	TopDownrdata（> = 0.2），尼特，，，，游侠，，，，测试，，，，生物使用，，，，XML2
系统要求
增强
URL	https://github.com/sgibb/topdownr/
BugReports	https://github.com/sgibb/topdownr/issues/
取决于我	TopDownrdata
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	topdownr_1.14.0.tar.gz
Windows二进制	topDownr_1.14.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	topdownr_1.14.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/topdownr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/topdownr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/topdownr/
软件包下载报告	下载统计