Bioconductor版本:释放(3.13)
可视化映射读数以及注释作为NGS数据集的轨道层,例如芯片SEQ,RNA-SEQ,MiRNA-SEQ,DNA-SEQ,SNP和甲基化数据。
维护者:建红欧<建虹。杜克·德杜>
引文(从R内,输入引文(“TrackViewer”)
):
要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:
if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“trackviewer”)
对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放。
要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:
BROWSEVIGNETTES(“TrackViewer”)
HTML. | r script. | TrackViewer Vignette:更改曲目样式 |
HTML. | r script. | TrackViewer Vignette:Dandelionplot |
HTML. | r script. | TrackViewer Vignette:Lollippplot |
HTML. | r script. | TrackViewer Vignette:概述 |
HTML. | r script. | TrackViewer Vignette:绘图交互数据 |
PDF. | 参考手册 | |
文本 | 消息 |
Biocviews. | 2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 |
版本 | 1.28.0 |
在生物导体中以来 | BIOC 2.14(R-3.1)(7年) |
执照 | GPL(> = 2) |
依靠 | r(> = 3.5.0),grdevices,方法,Genomicranges., 网格,rcpp. |
进口 | genomeinfodb.那基因管理那基因组法那GVIZ.那RSAMTOOLS.那S4Vectors.那rtracklayer.那生物根系那秤, 工具,绞喉那annotationdbi.那gr那HTMLWidgets.那Plotrix.那rghrachviz那互动那图形,实用,RHDF5. |
链接到 | rcpp. |
建议 | 生物雕那txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.那运行那org.hs.eg.db.那生物焦那kn那VariantAnnotation.那Httr.那htmltools.那RAMAMAMDOW. |
系统要求 | |
加强 | |
URL. | |
取决于我 | |
进口我 | Nadfinder. |
建议我 | Atacseqqc.那Chippeakanno. |
链接给我 | |
建立报告 |
跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。
源包 | trackviewer_1.28.0.tar.gz. |
Windows二进制文件 | trackviewer_1.28.0.zip.(32-&64位) |
Macos 10.13(高塞拉) | trackviewer_1.28.0.tgz. |
源存储库 | git clone https://git.biocumon.org/packages/trackviewer. |
源存储库(开发人员访问) | git clone git@git.biocondion.org:包/ TrackViewer |
包短网址 | https://biocumon.org/packages/trackviewer/ |
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