TrackViewer.

DOI:10.18129 / b9.bioc.trackviewer.

具有Web界面的R / Biocumondop封装,用于绘制优雅的交互式轨道或棒棒糖曲线,以促进对多OMICS数据的综合分析

Bioconductor版本:释放(3.13)

可视化映射读数以及注释作为NGS数据集的轨道层,例如芯片SEQ,RNA-SEQ,MiRNA-SEQ,DNA-SEQ,SNP和甲基化数据。

作者:建红欧[AUT,CRE],朱莉丽华朱[aut]

维护者:建红欧<建虹。杜克·德杜>

引文(从R内,输入引文(“TrackViewer”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!percennamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“trackviewer”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“TrackViewer”)

HTML. r script. TrackViewer Vignette:更改曲目样式
HTML. r script. TrackViewer Vignette:Dandelionplot
HTML. r script. TrackViewer Vignette:Lollippplot
HTML. r script. TrackViewer Vignette:概述
HTML. r script. TrackViewer Vignette:绘图交互数据
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

Biocviews. 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.28.0
在生物导体中以来 BIOC 2.14(R-3.1)(7年)
执照 GPL(> = 2)
依靠 r(> = 3.5.0),grdevices,方法,Genomicranges., 网格,rcpp.
进口 genomeinfodb.基因管理基因组法GVIZ.RSAMTOOLS.S4Vectors.rtracklayer.生物根系, 工具,绞喉annotationdbi.grHTMLWidgets.Plotrix.rghrachviz互动图形,实用,RHDF5.
链接到 rcpp.
建议 生物雕txdb.hsapiens.ucsc.hg19.knowngene.运行org.hs.eg.db.生物焦knVariantAnnotation.Httr.htmltools.RAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL.
取决于我
进口我 Nadfinder.
建议我 Atacseqqc.Chippeakanno.
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 trackviewer_1.28.0.tar.gz.
Windows二进制文件 trackviewer_1.28.0.zip.(32-&64位)
Macos 10.13(高塞拉) trackviewer_1.28.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/trackviewer.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ TrackViewer
包短网址 https://biocumon.org/packages/trackviewer/
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支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户