traviz

DOI:10.18129 / B9.bioc.traviz

用于可视化和解释的轨迹函数。

Bioconductor版本:Release (3.15)

traviz提供了一套函数来从Bioconductor包中绘制轨迹相关对象。它允许在降低维度绘制轨迹，以及平均基因表达平滑作为伪时间的函数。除了一般的效用函数，traviz还允许绘制由Slingshot估计的轨迹，以及由tradeSeq估计的平滑轨迹。此外，它允许使用ggplot2可视化Slingshot轨迹。

作者:Hector Roux de Bezieux [aut, ctb]， Kelly Street [aut, ctb]， Koen Van den Berge [aut, cre]

维护者:Koen Van den Berge < Koen。Vdberge在gmail.com>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“traviz”)

超文本标记语言	R脚本	Ggplot2 +弹弓
超文本标记语言	R脚本	traviz
PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.14 (R-4.1)(0.5年)
许可证	MIT +文件许可
取决于	R (>= 4.0)
进口	ggplot2，冬青，mgcv，SingleCellExperiment，弹弓，princurve，Biobase、方法、RColorBrewer，SummarizedExperiment， grDevices，图形，rgl
链接
建议	嘘，dplyr，testthat(> = 3.0.0),covr，S4Vectors，rmarkdown，knitr
SystemRequirements
增强了
URL
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	traviz_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	traviz_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	traviz_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/traviz
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/traviz
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/traviz/
软件包下载报告	下载数据