tripr

DOI:10.18129 / B9.bioc.tripr

t细胞受体/免疫球蛋白谱仪

Bioconductor版本:Release (3.15)

TRIP是一个提供抗原受体(B细胞受体免疫球蛋白，BcR IG | T细胞受体，TR)基因序列数据分析服务的软件框架。它是一个用R Shiny编写的web应用程序。它将IMGT/HighV-Quest工具的输出文件作为输入。用户可以选择分别分析来自每个输入样本的数据，也可以选择来自所有样本的组合数据文件并相应地可视化结果。

作者:Maria Th。Kotouza [aut]， Katerina Gemenetzi [aut]， Chrysi Galigalidou [aut]， Elisavet Vlachonikola [aut]， Nikolaos Pechlivanis [aut]， Andreas Agathangelidis [aut]， Raphael Sandaltzopoulos [aut]， Pericles A. Mitkas [aut]， Kostas Stamatopoulos [aut]， Anastasia Chatzidimitriou [aut]， Fotis E. Psomopoulos [aut]， Iason Ofeidis [cre]

维护者:Iason Ofeidis

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

要查看系统中安装的此包版本的文档，请启动R并输入:

browseVignettes(“tripr”)

超文本标记语言	R脚本	tripr用户指南
PDF		参考手册
文本		新闻
文本		许可证

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在Bioconductor	BioC 3.14 (R-4.1)(0.5年)
许可证	MIT +文件许可证
取决于	闪亮的(> = 1.6.0),shinyBS
进口	shinyjs，shinyFiles，plyr，data.table，DT，stringr，stringdist，plot3D，gridExtra，RColorBrewer，情节，dplyr，pryr，配置(> = 0.3.1),傀儡(>= 0.3.1)，方法，grDevices，图形，统计，utils
链接
建议	BiocGenerics，shinycssloaders，tidyverse，BiocManager，Biostrings，xtable，rlist，motifStack，knitr，rmarkdown，testthat(> = 3.0.0),fs，BiocStyle，RefManageR，biocthis
SystemRequirements
增强了	平行
URL	https://github.com/BiodataAnalysisGroup/tripr
BugReports	https://github.com/BiodataAnalysisGroup/tripr/issues
全靠我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	tripr_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	tripr_1.2.0.zip
macOS 10.13 (High Sierra)	tripr_1.2.0.tgz
源库	Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tripr
源存储库(开发人员访问)	Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tripr
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/tripr/
软件包下载报告	下载数据