tspair

DOI:10.18129 / B9.bioc.tspair

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微阵列分类最高得分对

Bioconductor版本:Release (3.16)

这些函数计算两个用户指定组之间显示最大排序差异的基因对。这个“最高得分对”使用数据集中的一对基因,最大限度地提高了所有基于排名的分类器的灵敏度和特异性的平均值。仅根据一对基因的相对等级对样本进行分类的优点是:(a)分类器比更复杂的分类方案简单得多,而且往往更易于解释;(b)如果仅使用一对基因就可以对阵列进行分类,则可以使用基于PCR的测试对样本进行分类。有关TSP分类器的参考,请参阅tspcalc()函数的参考资料。

作者:Jeffrey T.韭菜

维护者:Jeffrey T. Leek

引用(来自R,输入引用(“tspair”)):

安装

要安装这个包,启动R(版本"4.2")并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE) install.packages("BiocManager") BiocManager::install("tspair")

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文档

PDF 参考手册

细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 1.56.0
在Bioconductor中 BioC 2.4 (R-2.9)(13.5年)
许可证 GPL-2
取决于 R (>= 2.10),Biobase(> =测试盒框)
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包档案

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源包
Windows二进制
macOS二进制文件(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源库 Git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tspair
源存储库(开发人员访问) Git克隆git@git.bioconductor.org:packages/tspair
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/tspair/
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