twoddpcr

doi：10.18129/b9.bioc.twoddpcr

分类2-D液滴数字PCR（DDPCR）数据并量化起始分子的数量

生物导体版本：版本（3.15）

TWODDPCR软件包从Bio-Rad的Quantasoft获取液滴数字PCR（DDPCR）液滴振幅数据，并可以对液滴进行分类。可以生成正/负液滴计数的摘要，然后可以使用泊松分布来估计分子的数量。这是第一个开源软件包，可促进一般两个通道DDPCR数据的自动分类。先前的工作包括“侦探”（Jones等人，2014年）和“ DDPcrquant”（Trypsteen等，2015），它们仅处理一个通道DDPCR实验。Cran上可用的“ DDPCR”软件包（Attali等，2016）仅支持两种两个通道DDPCR实验的特定类别的门控。

作者：Anthony Chiu [AUT，CRE]

维护者：Achiu.me>的Anthony Chiu

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ Biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ Biocmanager”）Biocmanager :: install（“ twoddpcr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ twoddpcr”）

html	R脚本	TWODDPCR：用于液滴数字PCR分析的软件包
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.20.0
在生物导体中	Bioc 3.5（R-3.4）（5年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 3.4）
进口	班级，，，，GGPLOT2，，，，Hexbin， 方法，秤，，，，闪亮的，统计，utils，rcolorbrewer，，，，S4VECTORS
链接
建议	DevTools，，，，尼特，，，，RESHAPE2，，，，rmarkDown，，，，测试，，，，生物使用
系统要求
增强
URL	http://github.com/crukmi-computationalbiology/twoddpcr/
BugReports	http://github.com/crukmi-computationalbiology/twoddpcr/issues/
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	twoddpcr_1.20.0.tar.gz
Windows二进制	twoddpcr_1.20.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	twoddpcr_1.20.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/twoddpcr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/twoddpcr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/twoddpcr/
软件包下载报告	下载统计