txcutr

doi：10.18129/b9.bioc.txcutr

转录组切割器

生物导体版本：版本（3.15）

各种mRNA测序库制备方法生成的测序读取是从转录末端进行的。通过在对齐或伪对准阶段以及下游分析中，可以使用截短版本的转录组注释版本的截短版本的转录组注释版本，可以通过使用截短版本的转录组注释版本来帮助从此类数据进行量化的分析。该软件包实现了一些方便方法，以容易生成此类截断的注释及其相应的序列。

作者：Mervin Fansler [AUT，CRE]

维护者：Mervin Fansler

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.2”）并输入：

if（！quired（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ txcutr”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

browsevignettes（“ txcutr”）

html	R脚本	TXCUTR简介
PDF		参考手册
文本		消息

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.14（R-4.1）（1年）
执照	GPL-3
要看	R（> = 4.1.0）
进口	AnnotationDbi，，，，GenomicFeatures，，，，iranges，，，，基因组机，，，，生物基因，，，，生物弦，，，，S4VECTORS，，，，rtracklayer，，，，生物比较，统计，方法，utils
链接
建议	Refmanager，，，，生物使用，，，，尼特，，，，SessionInfo，，，，rmarkDown，，，，测试（> = 3.0.0），txdb.scerevisiae.ucsc.saccer3.sgdgene，，，，BSGENOME.SCEREVISIAE.UCSC.SACCER3
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	txcutr_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	txcutr_1.2.0.zip（仅64位）
MacOS 10.13（高山脉）	txcutr_1.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/txcutr
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/txcutr
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/txcutr/
软件包下载报告	下载统计