漩涡

DOI:10.18129 / b9.bioc.vasp

这是发展vasp的版本;对于稳定的版本版本,请参阅漩涡

群体拼接变化的量化和可视化

Bioconductor版本:开发(3.13)

从短读RNA-SEQ数据和出版质量多面板数字的基因剪接信息的可视化发现基因组 - 宽可变替代拼接事件。

作者:惠辉宇,钱杜,志张

维护者:惠辉yu

引文(从R内,输入引文(“VASP”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!carcenamespace(“biocmanager”,squilly = true))install.packages(“biocmanager”)#下面初始化buoc devel biocmanager :: install的使用(版本='devel')biocmanager ::安装(“vasp”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

要查看系统中安装此包版本的文档,请启动r并输入:

BROWSEVIGNETTES(“VASP”)

HTML. r script. 人口拼接的变化
PDF. 参考手册
文本 消息

细节

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版本 1.3.4
在生物导体中以来 BIOC 3.11(R-4.0)(1年)
执照 gpl(> = 2.0)
依靠 r(> = 4.0),舞会礼服
进口 绞喉Genomicranges.S4Vectors.寿司, 平行,MatrixStats.基因管理Genomeinfodb.RSAMTOOLS.,统计,图形,方法
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.
系统要求
加强
URL. https://github.com/yuhuihui2011/vasp.
Bugreports. https://github.com/yuhuihui2011/vasp/issues.
取决于我
进口我
建议我
链接给我
建立报告

包档案包

跟随2021年欧洲杯比分预测 在r会话中使用此包的说明。

源包 vasp_1.3.4.tar.gz.
Windows二进制文件 vasp_1.3.4.zip.
Macos 10.13(高塞拉) vasp_1.3.4.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/vasp.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocumon.org:包装/ vasp
包短网址 https://biocumon.org/packages/vasp/
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支持»

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  • 支持网站- 关于生物导体包的问题
  • Bioc-devel.邮件列表 - 适用于包开发人员2021欧洲杯体育投注开户