Velociraptor

doi：10.18129/b9.bioc.velociraptor

单细胞速度的工具包

生物导体版本：版本（3.13）

该软件包为单细胞RNA-seq数据中的RNA速度计算提供了生物友好的包装器。我们使用Basilisk软件包来管理CONDA环境，以及Zellkonverter软件包在SingleCellexperiment（R）和Anndata（Python）之间转换数据结构。速度方法产生的信息存储在单链体式类别的各个组件中。

作者：Kevin Rue-Albrecht [AUT，CRE]，亚伦·伦[自动]，夏洛特·索尼森[aut]，迈克尔·斯塔德（Michael Stadler）[AUT]

维护者：kevin rue-albrecht

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ velociraptor”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Velociraptor”）

html	R脚本	用户指南
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看	总结性特征
进口	方法，统计，矩阵，，，，生物基因，，，，网状，，，，S4VECTORS，，，，延迟，，，，蛇怪，，，，Zellkonverter，，，，砍伐，，，，Singlecellexperiment，，，，生物比较，，，，生物兴奋
链接
建议	生物使用，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，pkgdown，，，，斯克兰，，，，评分，，，，scrnaseq，，，，RTSNE，图形，grdevices，GGPLOT2，，，，牛仔图，，，，ggally，，，，拼布，，，，metr
系统要求
增强
URL	https://github.com/kevinrue/velociraptor
BugReports	https://github.com/kevinrue/velociraptor/issues
取决于我	奥斯卡
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	velociraptor_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	velociraptor_1.2.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	velociraptor_1.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/velociraptor
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/velociraptor
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/velociraptor/
软件包下载报告	下载统计