VSN.

DOI：10.18129 / b9.bioc.vsn.

微阵列数据的方差稳定和校准

Bioconductor版本：释放（3.13）

该包装实现了一种用于归一化微阵列强度的方法，以及用于单色和多色阵列的工作。它也可以用于来自其他技术的数据，只要它们具有类似的格式。该方法使用最大似然估计器的鲁棒型，用于添加 - 乘法误差模型和仿射校准。该模型包括数据校准步骤（A.K.A.归一化），是依赖于平均强度的差异的模型和稳定数据变换的方差。转换强度之间的差异类似于“归一化对数比率”。然而，与后者相比，它们的差异与平均值无关，并且它们通常更敏感，并且在检测差分转录方面是更敏感的。

作者：Wolfgang Huber，来自Anja Von Heydebereck的贡献。用户的许多意见和建议被承认，其中包括Dennis Kostka，David Kreil，Hans-Ulrich Klein，Robert绅士，Deepayan Sarkar和Gordon Smyth

维护者：Wolfgang Huber

安装

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细节

Biocviews.	2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯 那2021年欧洲杯
版本	3.60.0
在生物导体中以来	BIOC 1.6（R-2.1）或更早（> 16年）
执照	艺术-2.0
依靠	r（> = 3.4.0），BioBase.
进口	方法，敬服那林马那格子那ggplot2.
链接到
建议	yefydata.那hgu95av2cdf.那生物焦那kn那dplyr.那testthat.
系统要求
加强
URL.	http://www.r-project.org.http://www.ebi.ac.uk/huber.
取决于我	怀特拉拉那cellhts2.那rnaseqgene.那webbioc.
进口我	ArrayqualityMetrics.那BNEM.那coexnet.那达巴马尔那张那Doscheda.那ExpressionNormalizationWorkflow.那ImageHts.那matrixqcvis.那METASEQR2.那msnbase.那armanalyzerde.那PVCA那林诺那t
建议我	adsplit.那Beadarray.那Bioccasestudies.那deseq2.那雌激素那Flowvs.那GGBIO.那Globalancova那全球化境那林马那lumi.那Mscoreutils.那PAA.那qfeatures.那SCP.那暮
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源包	vsn_3.60.0.tar.gz.
Windows二进制文件	vsn_3.60.0.zip.
Macos 10.13（高塞拉）	vsn_3.60.0.tgz.
源存储库	git clone https://git.biocumon.org/packages/vsn.
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.biocondion.org：包/ vsn
包短网址	https://biocumon.org/packages/vsn/
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