Wiggleplotr.

DOI:10.18129 / b9.bioc.wiggleplotr.

从Bigwig文件中读取覆盖范围

Bioconductor版本:释放(3.13)

从排序实验与基因组注释(基因,转录物,峰)一起可视化读取覆盖的工具。可以重新分配长转录物的内含子,以便更好地可视化偏振读取覆盖范围。

作者:kaur alasoo [aut,cre]

维护者:kaur alasoo

引文(从R内,输入引文(“Wiggleplotr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.1”)并输入:

if(!quancameSpace(“BiocManager”,静静= True))install.packages(“biocmanager”)biocmanager ::安装(“wiggleplotr”)

对于旧版本,请参阅相应的生物导体释放

文件

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Browsevignettes(“Wiggleplotr”)

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细节

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版本 1.16.0
在生物导体中以来 BIOC 3.5(R-3.4)(4年)
执照 Apache License 2.0.
依靠 r(> = 3.6)
进口 dplyr.ggplot2.(> = 2.2.0),Genomicranges.rtracklayer.电台assertthat.邮风S4Vectors.绞喉genomeinfodb.
链接到
建议 knRAMAMAMDOW.生物雕基因组法testthat.Ensembldb.ensdb.hsapiens.v86org.hs.eg.db.txdb.hsapiens.ucsc.hg38.knowngene.annotationdbi.annotationfilter.
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源包 wiggleplotr_1.16.0.tar.gz.
Windows二进制文件 wiggleplotr_1.16.0.zip.
Macos 10.13(高塞拉) Wiggleplotr_1.16.0.tgz.
源存储库 git clone https://git.biocumon.org/packages/wiggleplotr.
源存储库(开发人员访问) git clone git@git.biocondion.org:包/ Wiggleplotr
包短网址 https://biocumon.org/packages/wiggleplotr/
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