ZFPKM

doi：10.18129/b9.bioc.zfpkm

一套促进ZFPKM转换的功能

生物导体版本：版本（3.12）

在RNA-Seq FPKM数据上执行ZFPKM变换。该算法基于Hart等人的出版物，2013年（PubMed ID 24215113）。参考建议使用ZFPKM> -3选择表达的基因。用编码打开/封闭的染色体数据验证。使用FPKM或TPM可以很好地适用于基因水平数据。对于成绩单级别的数据，似乎无法很好地校准。

作者：Ron Ammar [AUT，CRE]，John Thompson [AUT]

维护者：Ron Ammar

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.0”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ zfpkm”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ ZFPKM”）

html	R脚本	ZFPKM转换简介
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.12.0
在生物导体中	Bioc 3.6（R-3.4）（3年）
执照	GPL-3 |文件执照
要看	R（> = 3.4.0）
进口	检查员，，，，dplyr，，，，GGPLOT2，，，，花花公子，，，，总结性特征
链接
建议	尼特，，，，林玛，，，，EDGER，，，，地球，，，，Stringr，，，，普林特
系统要求
增强
URL	https://github.com/ronammar/zfpkm/
BugReports	https://github.com/ronammar/zfpkm/issues
取决于我
进口我
建议我
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	ZFPKM_1.12.0.TAR.GZ
Windows二进制	ZFPKM_1.12.0.zip
MacOS 10.13（高山脉）	ZFPKM_1.12.0.TGZ
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zfpkm
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：包装/ZFPKM
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/zfpkm/
软件包下载报告	下载统计