Zellkonverter

doi：10.18129/b9.bioc.zellkonverter

scrna-seq对象之间的转换

生物导体版本：版本（3.13）

提供了在Python Anndata对象和SingleCellexperiment对象之间转换的方法。这些主要旨在由下游生物导体包装包装Python方法进行单细胞数据分析。它还包括用于读取和编写用于将AnnData对象保存到磁盘的H5AD文件的功能。

作者：卢克·扎皮亚（Luke Zappia）[AUT，CRE]，亚伦·伦[自动]

维护者：Luke Zappia

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“ 4.1”）并输入：

if（！sireseenamespace（“ biocmanager”，悄悄= true））install.packages（“ biocmanager”）biocmanager :: install（“ zellkonverter”）

对于R的较旧版本，请参考适当的生物导体释放。

文档

要查看系统中安装此软件包的版本的文档，请启动R并输入：

Browsevignettes（“ Zellkonverter”）

html	R脚本	转换为从Anndata转换为SingleCellexperiments
PDF		参考手册
文本		消息
文本		执照

细节

生物浏览	2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯 ，，，，2021年欧洲杯
版本	1.2.0
在生物导体中	Bioc 3.12（R-4.0）（0.5岁）
执照	麻省理工学院 +文件执照
要看
进口	矩阵，，，，蛇怪，，，，网状，，，，Singlecellexperiment（> = 1.11.6），总结性特征，，，，延迟， 方法，S4VECTORS，UTILS
链接
建议	COVR，，，，拼写，，，，测试，，，，尼特，，，，rmarkDown，，，，生物使用，，，，scrnaseq，，，，HDF5Array，，，，RHDF5，，，，Biocfilecache
系统要求
增强
URL	https://github.com/theislab/zellkonverter
BugReports	https://github.com/theislab/zellkonverter/issues
取决于我	OSCA.INTRO
进口我	Velociraptor
建议我	HDF5Array
链接到我
构建报告

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包	zellkonverter_1.2.0.tar.gz
Windows二进制	zellkonverter_1.2.0.zip（32-和64位）
MacOS 10.13（高山脉）	zellkonverter_1.2.0.tgz
源存储库	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/zellkonverter
源存储库（开发人员访问）	git clone git@git.bioconductor.org：packages/zellkonverter
包装短URL	//www.andersvercelli.com/packages/zellkonverter/
软件包下载报告	下载统计