1.9.2版更改o增加了函数writeSFF从SFFContainer对象创建一个.sff文件。o添加函数qualityReportSFF，为SFF文件创建pdf质量报告。修正了SFFContainers子集函数中的错误。o增加了从Roche最新的Amplicon Variant Analyzer (v2.7)读取数据的能力。o新方法ava2vcf写的变种在一个AVA-Set文件中的VCF格式。o多个错误修复。在plotvariables函数中增加了新的图形组件、选项和注释。1.3.1版更改o在读取Roche的.sff(标准流程格式)文件时增加了readSFF方法。o在SFFContainer, ShortReadQ和QualityScaledDNAStringSet格式中增加了对未对齐序列的质量控制功能。o增加了从SFFContainer写入FASTQ格式文件的功能。 Changes in version 1.1.2 o Added method for calculating Ti/Tv ratios. Changes in version 1.1.1 o Fixed bug in plotAmpliconCoverage().