版本1.9.1 -------------------------- o修正了在R版本4.0中与使用class(…)== "x"相关的编码错误。-------------------------- o我们为anota2seqGetOutput函数的输出参数添加了一个新选项，更多细节可以在函数帮助中找到。o小插图的质量控制部分扩展了更多的细节，此外，我们添加了一个低归一化数据的质量控制示例作为参考。o我们从总mRNA和翻译mRNA的分析输出中删除了apvSlope和apvSlopeP列，因为这些值不会用于RNA源差异表达分析。版本1.3.1 -------------------------- o修正了一个错误，在anota2seqPlotPvalues和anota2seqPlotFC中，当只选择一个对比度时，对比度名称不会正确显示，如果有多个对比度。使用带有自定义过滤参数的anota2seqRun函数对maxxp仍然基于0.15的maxPAdj。这是固定的，即当maxP过滤应用时，没有maxPAdj过滤器将被使用。-------------------------- o我们将语义buffering down改为buffered (mRNA up)， buffer up改为buffered (mRNA down) -因此解释更加直观。添加自定义选项到anota2seqPlotFC和anotat2seqPlotPvalues函数。修正了一个错误，一个统一的对象“regModes”正在被访问，导致没有信息的错误消息。更改在0.99.2版本-------------------------- o重命名以坚持类、函数和数据对象的Bioconductor命名风格o纠正anota2seq_data手册页中的错误o修改默认值(对于强制参数没有NULL默认值)o修复绘图函数中参数fileName的错误取代它的乳胶()删除本月/ doc和构建/文件夹o更新手册页o anota2seqDataSetFromSE assayNum的默认值改为1 o anota2seq显示方法的格式(和次要的文本编辑的描述对象)o anota2seqSelSigGenes o小调sortBy参数相关的固定问题文本编辑消息给用户o修正关于阈值线anota2seqPlotFC o固定错误在anota2seqSelSigGenes useRVM = FALSE,只有一个基因被选中 CHANGES IN VERSION 0.99.0 -------------------------- o First submitted version