版本1.8.0的变化——第五版本在bioconductor变化1.5.3 -删除citr更正方案描述的变化版本1.4.0 -第三版本在bioconductor变化1.3.1添加文件修复bug的变化版本1.2.0 -第二版bioconductor 1.1.14版本的变化——在mergeBSJunctions功能:——因为不同检测工具可以报告sligtly不同坐标在分组back-spliced连接之前,现在可以解决后者使用gtf文件。看到param fixBSJsWithGTF。1.1.5版本的变化——在plotMotifs功能:之前,只报道主题发现在前台序列。现在也主题发现在后台报告输出。改变版本1.1.4 - getMotifs功能:固定一个错误当削减BSJ序列。如通过设置宽度= 6,BSJ修剪,这样只剩下5核苷酸序列在每个BSJ。如果宽度= 7,那么剩下6个核苷酸的每一方BSJ等等的变化版本1.1.3——plotMotifs功能:添加n参数过滤图案。1.1.2版本的变化——改进的小插曲——plotMotifs功能:——为了避免无穷褶皱变化值1添加到每个主题出现的数量被发现前的前景和背景目标序列规范化。——添加角参数的旋转角轴标签。——添加removeNegLog2FC参数删除RBPs负log2FC。 - volcanoPlot function: - Added geneSet param that allows to show only specified host gene names. - In getMotifs function: - Included possibilities to use motifs of RBPs from MEME database Changes in version 1.0.0 - First release on bioconductor