版本0.2.1（2020-12-21）的更改 +使Epialleler的第二次迭代在版本0.3.1（2020-01-01） +重构中的可用软件包更改，几乎所有的内部方法添加了许多内部方法 + C ++功能瓶颈（快速：雪茄，摘要，基因组加载）版本0.3.2（2021-01-06） +首次尝试稳定API（generatecytosineereport和GenerateBedReport） + ECDF（GenerateBedecdf） + eCDF（GenerateBedecdf） +在Github中的临时方法版本0.3.5（2021-01-09） +大量重构 +新方法：PreprocessBam（），以节省加载/预处理的时间 +新的C ++ for std for std for std :: MAP摘要（5-10x speedup）的变化版本0.3.7（2021-01-12） +再次进行重构 + CX Report Sub现在使用boost :: container :: flat_map（附加的2x速度） +删除dplyr作为依赖性，整个软件包使用数据。现在可以更改版本0.3.9（2021-01-19） +快速的C ++雪茄分析器在参考空间中进行查询 +提取基本频率的新方法：generateBaseFreqReport版本0.4.0（2021-03-08） + public + cx报告现在仅包含超过50％的reads + generatevcfreport中的上下文（仅目前仅处理SNV） +添加的文档其中一些方法 +添加了几个示例 +添加了扩增子的示例数据，并捕获NGS +添加了一些基于示例数据 + readme.md版本0.99.0（2021-04-09）中的更改（2021-04-09） + r> = 4.0，以提交提交 + R> = 4.0删除的未使用依赖项 +生成vcfreport的正确工作（尽管仅SNV） +无与伦比的读取在GenerateBed*现在*现在的compiles + Compiles + Compiles＆在Apple Silicon（本机ARM64 R） +完全记录的方法 +完全覆盖的测试和示例 +综合范围Vignettes版本1.1.0（2021-05-21） +在BioConductor上发布的版本1.1.9（2021-09-19） +使用HTSLIB的最快记忆效率BAM加载 - 现在读取配对 - 端的BAM BAM仅 + min.baseq来减少测序误差的效果 + very fast Fisher Exact from HTSlib + old code removed Changes in version 1.3.2 (2021-12-24) + more efficient data handling (XPtr instead of Rcpp::wrap'ping) Changes in version 1.3.6 (2022-02-16) + significant speed-up (1.3.5) + methylation patterns