CHANGES IN VERSION 1.13.4 ------------------------- o重新创建Rd文档文件，以修复R CMD检查Windows CHANGES IN VERSION 1.13.3上的警告------------------------- o修复bamsignal -methods交叉引用，在R CMD检查Windows CHANGES IN VERSION 1.13.2 ------------------------- o修复使用未定义符号'idx'的vignette错误------------------------- o已更改已废弃'GenomeInfoDb::fetchExtendedChromInfoFromUCSC'到'GenomeInfoDb::getChromInfoFromUCSC'版本1.11.2的变化------------------------- o更改了已过时的'GenomeInfoDb::fetchExtendedChromInfoFromUCSC'版本1.11.2的变化------------------------- o在版本1.11.1中添加了正确的引用变化------------------------- o维护者电子邮件地址更新的版本1.3.1的变化-------------------------功能o ' summary() '输出更多简明o ' getEnrichment() '接受' F '用于指定所需的前景组件，用于浓缩的标准化o ' iterations '参数允许使用不同的起始值运行多个拟合o T过滤器阈值现在可以使用' minP '参数指定，用于不那么严格的过滤o通过指定prop的范围为小插曲添加了一个normmr概述方案。的H_0修正o固定提供GR对象的错误的瓷砖在char, char,农庄o ' diffR()”也更健壮的通过标签交换适合1.0.0版本的变化 ------------------------- o初始Bioconductor 0.99.7 3.3版本修改版本 ------------------------- 修正o装箱“基因组”现在报告正确的基因组坐标enrichR,性格,性格,data.frame-method diffR,字符,字符,data.frame-method政权,字符,字符,data.frame-method o更正所提供的范围对象的计数，并显示警告，如果它们不相同大小o getEnrichment()允许调整前景现在o T过滤器阈值现在控制在主要方法中的minP参数CHANGES in VERSION 0.99.6 ------------------------- FEATURES o summary() for NormRFit实例现在显示每个显著性水平o getEnrichment()的bin百分比用于计算SIMD优化的非标准化富集性能对于OpenMP >= ver4 change IN VERSION 0.99.5 ------------------------- FEATURES o summary()对于类型为“diffR”和“reger”的NormRFit实例，现在显示组件测试结果BUGFIXES o删除MAKEFLAG“-D_GLIBCXX_PARALLEL”，因为它是0.99.4版本的实验性变化------------------------- BUGFIXES o从src/Makevars CHANGES IN VERSION 0.99.3中删除PKG_CPPFLAGS和PKG_LIBS变量------------------------- BUGFIXES o修复导入roxygen2 CHANGES IN VERSION0.99.2 ------------------------- FEATURES o Vignette finished o文档NormRFit-class & NormRCountConfig-class更新BUGFIXES o部署.log删除了版本0.99.1 ------------------------- FEATURES o添加了normr-methods, BamCountConfig-class & NormRFit-class的示例o将所有文档移动到一个manpage (normr. rd) o Vignette:基于knitter的Vignette for normr finished o exportR():导出NormRFit对象到床，床图和bigWig o plot():为NormRFit对象生成一个小的诊断图diffR():切换标签的结果的交集增加特异性BUGFIXES o删除deploy.log o固定构建错误和警告o固定失败的测试更改在版本0.99.0 -------------------------功能o巨大的性能加速，通过数据压缩到唯一的tupels仅o Kahan求和为日志后测求和，以减少数值误差o标准化的c++丰富计算。exportR()函数提供了将拟合结果导出为标准化富集的区域床文件或bigWig轨道的方法，可以很好地比较各种ChIP-seq实验