M3Drop-Michaelis-Menten对Scrnaseq的辍学模型这是一个R包,可提供用于将修改的Michaelis-Mmenten方程拟合到单细胞测序实验中观察到的辍学模式的功能。以及针对使用唯一分子标识符(UMIS)定量的数据集量身定制的深度调整的负二项式(DANB)模型。提供了适合每个模型以及执行基于辍学的功能选择的功能。这些可用于减少下游分析(例如聚类或假频率分析)的技术噪声。为了进行比较,包括Brennecke等人(2015)中提出的用于检测显着高度可变基因的算法。安装:> require(“ devtools”)> install_github('tallulandrews/m3drop')或> source(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)> bioclite(bioclite(“ m3drop”)DevTools”)> install_github('tallulandrews/m3dexampledata')或> source(“ //www.andersvercelli.com/bioclite.r”)> bioclite(“ m3dexampledata”)