### R代码来自Vignette Source'Matrixrider.rnw'##########################################################################################################################################)库(tfbstools)库(BioStrings)pfm <-getmatrixbyId(jaspar2014,“ ma0004.1”)##以下序列具有一个完美的匹配##,因此它具有所有截止值的结果。序列<-dnastring(“ cacgtg”)getSeqoccupancy(sequence,pfm,0.1)getSeqoccupancy(序列,pfm,1)####################################################################################<-pfmatrixlist(PFM,PFM2)名称(PFMS)<-C(名称(PFM),名称(PFM2))##此计算两个PFMATRIXES的总亲和力。getSeqoccupancy(序列,PFM,0)