# #——风格,eval = TRUE,呼应= FALSE,结果=“黑名单”- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - BiocStyle::乳胶(use.unsrturl = FALSE) # #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #库(适当的)# sim.opts。张= RNAseq.SimOptions。2 grp (ngen = 20000, p.DE = 0.05, # lOD =“张”,lBaselineExpr =“张”)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # sim.opts。底= RNAseq.SimOptions。2 grp (ngen = 20000, p.DE = 0.05, # lOD =“底部”,lBaselineExpr =“底部”)# #——回声= TRUE, eval = FALSE,结果= FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # simres = runSims (Nreps = c (3、5、7、10), sim.opts = sim.opts。张,# DEmethod =“刨边机”,nsims = 20) # #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # = comparePower (simresα。类型=“罗斯福”,alpha.nominal = 0.1 #分层。=“expr”,δ= 0.5)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # summaryPower(权力)# # - - - - - eval = FALSE,回声= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # plotPower(权力)# # - - - - - eval = FALSE,回声= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # plotPowerTD(权力)# # - - - - - eval = FALSE,回声= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # plotFDcost(权力)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # plotAll(权力)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #权力。seqDepth (simres权力)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # = comparePower (simresα。类型=“罗斯福”,alpha.nominal = 0.1, #层= c(0 10 2 ^(1:7) * 10,正),过滤器。= expr”, #地层。过滤= 1,分层。=“expr”,δ= 0.5)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # = comparePower (simresα。类型=“罗斯福”,alpha.nominal = 0.1 #分层。=“分散”,目标。=“effectsize”,δ= 1)# #——回声= TRUE, eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # = comparePower (simresα。type = " pval ", alpha.nominal = 0.001 #分层。=“分散”,目标。=“effectsize”,δ= 1)# #——回声= TRUE,结果= TRUE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - sessionInfo ()