### R代码来自小插图来源的RefPlus。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:RefPlus。Rnw: 100 - 105 ################################################### ## 用稀释affydata包库(RefPlus)库(affydata)数据(稀释)sampleNames(稀释 ) ################################################### ### 代码块2号:RefPlus。Rnw: 109 - 111 ################################################### ## 计算使用RMA RMA强度函数。Ex0 < exprs (rma(稀释 )) ################################################### ### 代码块3号:RefPlus。Rnw: 116 - 120 ################################################### ## 背景正确,估计探测器的影响,并使用RMA计算# # RMA强度。帕拉功能。帕拉< -rma.para(稀释[1:3],bg = TRUE, exp = TRUE) Ex1 < - Para [[3 ]] ################################################### ### 代码块数量4:RefPlus。Rnw: 127 - 129 ################################################### ## 使用rmaplus RMA +强度的计算功能。Ex2 < - rmaplus(稀释,rmapara =对位,bg = TRUE ) ################################################### ### 代码块5号:RefPlus。Rnw: 134 - 139 ################################################### 票面价值(mfrow = c(2, 2))情节(Ex0[1],[1],不能光吃干饭pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[1])情节(Ex0 [2], Ex2 [2], pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[2])情节(Ex0[3],[3]不能光吃干饭,pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[3])情节(Ex0 [4], Ex2 [4], pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[4 ]) ################################################### ### 代码块6号:RefPlus。Rnw: 148 - 150 ################################################### Para2 < - rma.para(稀释[2:4],bg = TRUE, exp = TRUE)要是< rmaplus(稀释,rmapara = Para2, bg = TRUE ) ################################################### ### 代码块7号:RefPlus。Rnw: 156 - 157 ################################################### Ex4 < - (Ex2 +要是)/ 2 ################################################### ### 代码块8号:RefPlus。Rnw: 162 - 167 ################################################### 票面价值(mfrow = c(2, 2))情节(Ex0 [1], Ex4 [1], pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[1])情节(Ex0 [2], Ex4 [2], pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[2])情节(Ex0 [3], Ex4 [3], pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[3])情节(Ex0 [4], Ex4 [4], pch =“。”,主要= sampleNames(稀释)[4 ]) ################################################### ### 代码块9号:RefPlus。Rnw: 176 - 178 ################################################### sqrt(意思是((Ex0-Ex2) ^ 2)√意味着(Ex0-Ex3) ^ 2 )) ################################################### ### 代码块10号:RefPlus。Rnw: 181 - 182 ################################################### sqrt(意思是((Ex0-Ex4) ^ 2))