### R代码来自Vignette源'query.rnw'#############################################代码块号1:Data #########################################库(“注释”)数据(Sample.Extressionset)Affys < - FeatureNames(Sample.Expressionset)[490:500]AFFYS ##########################################代码块号码2:注释#####################################################库(“hgu95av2.db”)IDS < - getPmid(Affys,“Hgu95av2”)IDS < - Unlat(ID,Use.Names = False)ID < - 唯一(IDS[!是.NA(AS.Numeric(IDS))])长度(IDS)ID [1:10] #########################################################代码块第3号:getamsts ######################################### x < - pubmed(IDS [1:10])A <- XMLOOT(x)numabst < - 长度(xmlchildren(a))numabst ############################################代码块号4:query.rnw:170-179 ######################################## ARTS < - Vector(“列表”,length = numabst)absts < - rep(N.a,numabst)for(i在1:numabst){##为此抽象艺术生成pubmedab​​st对象[[i]] < - buildpubmedab​​st(a [i])##检索此抽象ABSTS的抽象文本[I] < - ABSTTEXT(艺术[[i]])}艺术[[7]] ####################################################代码块号5:query.rnw:203-206 #######################################发现< - grep(“cdna”,absts)goodabsts <- 艺术[找到]长度(Goodabsts)################################################## ### code chunk number 6: query.Rnw:222-224 ################################################### y <- genbank(ids[1:10], type="uid") b <- xmlRoot(y) ################################################### ### code chunk number 7: abst2HTML ################################################### fname <- tempfile() pmAbst2HTML(goodAbsts, filename=fname) fnameBase <- tempfile() pmAbst2HTML(goodAbsts, filename=fnameBase, frames=TRUE) ################################################### ### code chunk number 8: query.Rnw:267-268 ################################################### sessionInfo()