# # - - - - - eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - # #工作目录更改为# setwd明星输出的(“/道路/ / /输出一致”)图书馆(psichomics) # # # prepareGeneQuant SRR6368612ReadsPerGene.out (#”。选项卡”、“SRR6368613ReadsPerGene.out。选项卡”,#“SRR6368614ReadsPerGene.out。选项卡”、“SRR6368615ReadsPerGene.out。选项卡”,#“SRR6368616ReadsPerGene.out。选项卡”、“SRR6368617ReadsPerGene.out.tab”) # prepareJunctionQuant (“SRR6368612SJ.out。选项卡”、“SRR6368613SJ.out。选项卡”,#“SRR6368614SJ.out。选项卡”、“SRR6368615SJ.out。选项卡”,#“SRR6368616SJ.out。选项卡”、“SRR6368617SJ.out.tab”) # # - - - - - eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #库(psichomics) #数据< - loadLocalFiles(路径“/ / / psichomics /输入”)#名称(数据)#名称(数据[[1]])# # junctionQuant < - $ data[[1]]“结量化”# sampleInfo < - $ data[[1]]的元数据样本# #基因阅读数量和装载cRPKMs作为单独的数据帧# geneReadCounts < - $ data[[1]]的基因表达(计数)# cRPKM < - $ data[[1]]的基因表达(cRPKM) # # - - - - - eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #库(psichomics) # psichomics () # # - - - - - eval = FALSE - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - #库(psichomics) #数据< - loadLocalFiles(路径“/ / / psichomics /输入”)#名称(数据)#名称(数据[[1]])# # geneExpr < - $ data[[1]]“基因表达”# junctionQuant < - $ data[[1]]“结量化”# sampleInfo < - $ data[[1]]的元数据样本