识别{siggenes} R文档

SAM特定识别方法

描述

通过单击SAM图中的相应点获得有关基因的基因特异性信息

用法

识别（x，showText = true，getInfo = true，pos = 4，cex = 0.8，add.xy = numeric（2），n.digits = 3，ask = false，ll = false，browse = false = false，chip = =““，...））

参数

X SAM对象
ShowText 逻辑指示是否应在确定点附近绘制基因名称
pos 数值值指定绘制基因名称的位置。默认为4（在点的右边）。有关详细信息和其他规格，请参见？文本
CEX 数值指定绘制文本的相对大小。有关详细信息，请参见？
添加，xy 长度2的数值向量。绘制文本add.xy [1]X方向和add.xy [2]Y方向的单位从默认情况下绘制的位置绘制的位置
n.Digits 整数指定输出中的小数位数
问 逻辑指示是否应在识别下一点之前要求用户
二 逻辑指示是否应将基因的链接和基因的符号添加到输出中
浏览 逻辑指示是否打开了与确定点的基因座链接相对应的NCBI网页。如果忽略了ll = false
芯片 字符串指定此分析中使用的芯片类型。如果忽略了ll = false，如果论点数据在SAM（数据，CL，...）已由extressionset对象芯片不必指定
>代码> ... 其他选择，例如上校对于绘制的文字。看？文本

笔记

Sam由Tusher等人开发。（2001）。

!!!斯坦福大学的SAM技术有一项专利。!!!

作者

Holger Schwender，holger.schw@gmx.de

参考

Tusher，V.G.，Tibshirani，R。和Chu，G。（2001）。用于电离辐射响应的微阵列的显着性分析。PNAS，98，5116-5121。

也可以看看

山姆，，，，山姆类，，，，概括