情节{siggenes} | R文档 |
生成由类EBAM对象给出的后验概率的图。
图(x,y,pos.stats = 2,sig.col = 3,sig.cex = 1,pCH = null,stats.cex = 0.8,main = null,xlab = null,ylab,ylab = null,y.intersp = =1.3,...)
X |
班级ebam的对象 |
y |
增量值,即基因称为差异表达的最小概率 |
pos.stats |
0到4之间的整数pos.stats = 1 ,一般信息作为重要基因的数量和指定值的估计FDRy 将绘制在情节的上心。如果pos.stats = 2 ,如果这些信息将在右下角绘制pos.stats = 3 在左下角,如果pos.stats = 4 在左上角。如果pos.stats = 0 ,不会绘制任何信息 |
sig.col |
显着基因的颜色的规范。有关如何指定颜色的说明,请参见par |
sig.cex |
一个数值,给出的数量应相对于默认值缩放重要基因的符号 |
PCH |
要么指定符号或单个字符的整数用作绘制点的默认值。为了描述如何PCH 可以指定,请参阅par |
stats.cex |
相对于默认大小,图中打印的统计数据的大小 |
主要的 |
字符串命名情节的主要标题 |
XLAB |
字符串命名X轴的标签 |
ylab |
字符串命名Y轴的标签 |
Y.Intersp |
一个数字值,指定绘制统计信息的行之间的空间 |
... |
EBAM图的其他图形参数。查看帮助页plot.default 和par |
基因的后验概率的图,以指定的值三角洲
Holger Schwender,holger.schw@gmx.de
Efron,B.,Tibshirani,R.,Storey,J.D。和Tusher,V。(2001)。微阵列实验的经验贝叶斯分析,Jasa,96,1151-1160。
Schwender,H.,Krause,A。和Ickstadt,K。(2003)。经验贝叶斯的比较和微阵列的显着性分析。技术报告,SFB 475,德国多特蒙德大学。