来自vignette source的tRanslatome_package的R代码。Rnw ' ################################################### ### 代码块1号:tRanslatome_package。Rnw: 55 - 75 ################################################### ## 加载tRanslatome包库(tRanslatome) # #加载训练数据集数据(tRanslatomeSampleData) tRanslatome。分析<- newTranslatomeDataset(expressionMatrix, c("tot.undiff. "”、“tot.undiff。B”，“tot.diff. c”)，c(“tot.diff. c”)。”、“tot.diff。B "， "tot.diff.c")， c("pol.undiff. c")。”、“pol.undiff。B "， "pol.diff. c")， c("pol.diff. c")。”、“pol.diff。B”，“pol.diff.c”)，标签。Level = c(“转录组”，“翻译组”)，标签。条件=c(“未分化的”，“分化的”))DEGs <- computeDEGs(transllatome。analysis, method= "limma"， multi .cor=TRUE) ##所选DEGs的富集分析CCEnrichment <- GOEnrichment(limma。DEGs，本体="CC"， class sofdegs ="up"，测试。=“琳”方法,测试。threshold = 0.05) ##performing a comparison of the biological themes enriched ##in the two levels of gene expression CCComparison <- GOComparison(CCEnrichment)