BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked

Danio rerio全掩模基因组序列(UCSC版本danRer7)

Bioconductor版本:发行版(3.13)

斑马鱼的全基因组序列由UCSC提供(danRer7, 2010年7月)，并存储在Biostrings对象中。序列与bsgome . derio . ucsc中相同。danRer7，但它们每个都在上面有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)连组内歧义掩码(AMB掩码)，(3)来自RepeatMasker的重复掩码(RM掩码)，以及(4)来自串联重复查找器的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

安装

要安装此包，启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgome . derio . ucsc . danrer7 .mask ")

对于较老版本的R，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7
进口	BSgenome，BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。

源包	BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Drerio.UCSC.danRer7.masked/
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