BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked

针刺胃骨全隐藏基因组序列(UCSC版gasAcu1)

Bioconductor版本:发行版(3.13)

由UCSC (gasAcu1, 2006年2月)提供并存储在Biostrings对象中的刺棘棘骨的完整基因组序列。序列与BSgenome.Gaculeatus.UCSC相同。gasAcu1，除了它们每个都在上面有以下4个掩码:(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装此包，请启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . gaculeatus . ucsc . gasacu1 .mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1
进口	BSgenome，BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1
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包档案

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源包	BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Gaculeatus.UCSC.gasAcu1.masked/
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