BSGENOME.MMULATTA.UCSC.RHEMAC2.MASKED

doi：10.18129/b9.bioc.bsgenome.mmulatta.ucsc.rhemac2.masked

Macaca Mulatta的完整蒙版基因组序列（UCSC版本RHEMAC2）

生物导体版本：版本（3.13）

UCSC（Rhemac2，2006年1月）提供的Macaca Mulatta（Rhesus）的完整基因组序列，并存储在生物弦对象中。这些序列与bsgenome.mmulatta.ucsc.rhemac2中的序列相同，除了它们每个序列在顶部都有4个接下来的掩码：（1）组装间隙的掩码（agaps mask）（agaps mask），（2）contra insra Intra contig的掩码歧义（Ambmask），（3）RepotMasker（RM Mask）的重复掩码，以及（4）串联重复搜索器（TRF蒙版）的重复掩码。默认情况下，只有agaps和amb掩模是“活动”的。注意：在UCSC上可用的大多数组件中，对串联重复序列重复序列进行过滤以仅保留含量<= 12的重复序列。但是，该组件省略了过滤器，因此TRF掩码包含所有串联重复序列的结果。

作者：生物导体开发团队

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