bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked

doi:10.18129/b9.bioc.bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked

Mus肌肉的完整掩盖基因组序列(UCSC基因组MM10,基于GRCM38.P6)

生物导体版本:版本(3.15)

UCSC(基因组MM10,基于GRCM38.P6)提供的us肌肉(小鼠)的完整基因组序列,并存储在生物弦物体中。这些序列与BSGENOME.MMUSCULUS.UCSC.MM10中的序列相同,除了每个序列在顶部都有2个接下来的掩码:(1)组装间隙的掩码(AGAPS掩码)和(2)(2)内部的掩码。contig歧义(amb掩膜)。

作者:生物导体开发团队

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if(!quired(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ bsgenome.mmusculus.ucc.ucsc.mm10.masked”)

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执照 艺术2.0
要看 r(> = 3.5.0),BSGENOME(> = 1.60.0),bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10
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源包 bsgenome.mmusculus.ucsc.mm10.masked_1.4.3.tar.gz
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