Bioconductor版本:发行版(3.15)
musculus (Mouse)的全基因组序列由UCSC提供(mm9, 2007年7月)并存储在Biostrings对象中。序列与bsgome . mmusculus . ucsc中相同。mm9,但每个掩码上都有以下4个掩码:(1)集间隙掩码(AGAPS掩码),(2)组内歧义掩码(AMB掩码),(3)来自RepeatMasker的重复掩码(RM掩码),以及(4)来自串联重复查找器的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下,只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。
作者:Bioconductor开发团队
维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者
引用(从R中,输入引用(“BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:
如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgome . mmusculus . ucsc .mm .mask ")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 1.3.99 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 |
进口 | BSgenome,BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9 |
链接 | |
建议 | |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | r3Cseq |
我的链接 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked_1.3.99.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: