BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked

小家鼠全掩膜基因组序列(UCSC版本mm9)

Bioconductor版本:发行版(3.15)

musculus (Mouse)的全基因组序列由UCSC提供(mm9, 2007年7月)并存储在Biostrings对象中。序列与bsgome . mmusculus . ucsc中相同。mm9,但每个掩码上都有以下4个掩码:(1)集间隙掩码(AGAPS掩码),(2)组内歧义掩码(AMB掩码),(3)来自RepeatMasker的重复掩码(RM掩码),以及(4)来自串联重复查找器的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下,只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor包维护者< Bioconductor .org>的维护者

引用(从R中,输入引用(“BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked”)):

安装

要安装此包,启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgome . mmusculus . ucsc .mm .mask ")

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细节

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版本 1.3.99
许可证 艺术- 2.0
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源包 BSgenome.Mmusculus.UCSC.mm9.masked_1.3.99.tar.gz
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