BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked

DOI:10.18129 / B9.bioc.BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked

泛穴居动物全掩模基因组序列(UCSC版本panTro3)

Bioconductor版本:Release (3.15)

由UCSC (panTro3, 2010年10月)提供并存储在Biostrings对象中的Pan troglodytes(黑猩猩)全基因组序列。序列与BSgenome.Ptroglodytes.UCSC相同。(1)组装间隙掩码(AGAPS掩码)，(2)contig内歧义掩码(AMB掩码)，(3)RepeatMasker中的重复掩码(RM掩码)，以及(4)Tandem repeats Finder中的重复掩码(TRF掩码)。默认情况下，只有AGAPS和AMB掩码是“活动的”。

作者:Bioconductor开发团队

维护者:Bioconductor Package维护者< Maintainer at Bioconductor .org>

安装

要安装这个包，启动R(版本“4.2”)并输入:

如果(!require("BiocManager"， quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" bsgenome . ptroglodyts . ucsc . pantro3 .mask ")

对于R的旧版本，请参考相应的Bioconductor释放．

文档

PDF		参考手册

细节

biocViews	2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯 ，2021年欧洲杯
版本	1.3.99
许可证	艺术- 2.0
取决于	BSgenome(> = 1.31.8),BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3
进口	BSgenome，BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3
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包档案

遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此包的说明。

源包	BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked_1.3.99.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url	//www.andersvercelli.com/packages/BSgenome.Ptroglodytes.UCSC.panTro3.masked/
软件包下载报告	下载数据