snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37

doi:10.18129/b9.bioc.snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37

HOMO SAPIENS的SNP位置(DBSNP构建142)

生物导体版本:版本(3.13)

从NCBI DBSNP构建中提取的HOMO SAPIENS的SNP位置和等位基因142.该软件包使用的源数据文件是由NCBI于2014年10月14日创建的,并包含用于参考基因组GRCH37.p13的SNP。警告:请注意,GRCH37.P13基因组是GRCH37的修补版本,但该补丁不会改变染色体1-22,X,Y,MT。GRCH37本身与来自UCSC *的HG19基因组相同,但对于线粒体染色体除外。因此,该软件包中的SNP可以在bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19中“注入”,它们将降落在正确的位置,但该注入将排除CHRM(即,该序列中不会注入任何内容)。

作者:herv \'e pag \'

维护者:Simon Coetzee

引用(从r内,输入引用(“ snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“ 4.1”)并输入:

if(!sireseenamespace(“ biocmanager”,悄悄= true))install.packages(“ biocmanager”)biocmanager :: install(“ snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37”)

对于R的较旧版本,请参考适当的生物导体释放

文档

PDF 参考手册

细节

生物浏览 2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯 ,,,,2021年欧洲杯
版本 0.99.5
执照 艺术2.0
依靠 r(> = 2.10),iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME(> = 1.25.6)
进口 方法,utils,iranges,,,,GenomeInfodB,,,,基因组机,,,,BSGENOME
链接
建议 生物弦,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19,,,,bsgenome.hsapiens.ucsc.hg19.masked(> = 1.3.19)
系统要求
增强
URL
取决于我
进口我
建议我 Motifbreakr
链接到我

包装档案

跟随2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用此软件包的说明。

源包 snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37_0.99.5.tar.gz
Windows二进制
MacOS 10.13(高山脉)
包装短URL //www.andersvercelli.com/packages/snplocs.hsapiens.dbsnp142.grch37/
软件包下载报告 下载统计

文档»

生物导体

r/克兰软件包和文档

支持»

请阅读发布指南。向以下位置之一发布有关生物导体的问题:

  • 支持网站- 有关生物处理套件的问题
  • Bioc-devel邮件列表 - 包装开发人员2021欧洲杯体育投注开户