SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

DOI:10.18129 / B9.bioc.SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38

智人的SNP位点(dbSNP Build 144)

Bioconductor版本:发行版(3.13)

从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p2(一个补丁版本的GRCh38,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以在bsgome . hsapiens . ncbi中被“注入”。GRCh38或bsgome . hapiens . ucsc .hg38。

作者:Herve页面

维护人员:H. Pagès

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安装

要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:

如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" snplcs . hsapens . dbsnp144 . grch38 ")

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细节

biocViews 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯 2021年欧洲杯
版本 0.99.20
许可证 艺术- 2.0
取决于 BSgenome(> = 1.43.4)
进口 方法,跑龙套,BiocGenericsS4VectorsIRangesGenomeInfoDbGenomicRangesBSgenome
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建议 BiostringsBSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38
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包档案

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源包 SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.20.tar.gz
Windows二进制
macOS 10.13 (High Sierra)
包短Url //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/
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