Bioconductor版本:发行版(3.13)
从NCBI dbSNP Build 144中提取的智人SNP位点和等位基因。用于此包的源数据文件由NCBI于2015年5月30日创建,包含映射到参考基因组GRCh38的snp。p2(一个补丁版本的GRCh38,不改变染色体1-22,X, Y, MT)。注意,这些snp可以在bsgome . hsapiens . ncbi中被“注入”。GRCh38或bsgome . hapiens . ucsc .hg38。
作者:Herve页面
维护人员:H. Pagès
引用(从R中,输入引用(“SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38”)
):
要安装此包,启动R(版本“4.1”)并输入:
如果(!requireNamespace("BiocManager", quiet = TRUE)) install.packages("BiocManager") BiocManager::install(" snplcs . hsapens . dbsnp144 . grch38 ")
对于较老版本的R,请参考相应的Bioconductor释放.
参考手册 |
biocViews | 2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 ,2021年欧洲杯 |
版本 | 0.99.20 |
许可证 | 艺术- 2.0 |
取决于 | BSgenome(> = 1.43.4) |
进口 | 方法,跑龙套,BiocGenerics,S4Vectors,IRanges,GenomeInfoDb,GenomicRanges,BSgenome |
链接 | |
建议 | Biostrings,BSgenome.Hsapiens.UCSC.hg38 |
SystemRequirements | |
增强了 | |
URL | |
取决于我 | |
进口我 | |
建议我 | BSgenome,GenomicFeatures,MungeSumstats,XtraSNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38 |
我的链接 |
遵循2021年欧洲杯比分预测 在R会话中使用这个包的说明。
源包 | SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38_0.99.20.tar.gz |
Windows二进制 | |
macOS 10.13 (High Sierra) | |
包短Url | //www.andersvercelli.com/packages/SNPlocs.Hsapiens.dbSNP144.GRCh38/ |
包下载报告 | 下载数据 |
文档»
Bioconductor
支持»
请阅读发布指南.将有关Bioconductor的问题发送到以下地点之一: